membrány přepážky
tzv. hlavička základní jednotky
– shluk oxidačních a redukčních enzymů
krček základní jednotky
umístění základních jednotek
na povrchu přepážek
mitochondriální přepážky
ribosómy
Mitochondrie jsou viditelné ve světelném mikroskopu jako oválné až vláknité útvary v cytoplazmě. Jejich počet závisí na intenzitě látkové výměny buňky. Při studiu v elektronovém mikroskopu je patrné, že stěnu mitochondrií tvoří dvě jednotkové membrány. Vnitřní membrána je vychlípena dovnitř mitochondrie a tvoří neúplné přepážky. Na vnitřní membráně jsou uchyceny enzymy pro oxidaci látek, důležité pro uvolnění a uchování energie. Mitochondrie obsahují vlastní DNA, RNA a mají schopnost se reprodukovat.
Předpokládá se, že se původně jednalo o samostatné organismy (bakterie), které se v průběhu vývoje specializovaly na soužití s buňkami a obohatily energetické zdroje buněk o možnost oxidace.